Formules des acides amines, acides nucléiques et définitions en biochimie

Formule générale	Nom de l'acide aminé	Code à 3 lettres	Code à 1 lettre
	alanine	ala	A
	arginine	arg	R
	asparagine	asn	N
	acide aspartique	asp	D
	cystéine	cys	C
	glutamine	gln	Q
	glutamique	glu	E
	glycine	gly	G
	histidine	his	H
	isoleucine	ile	I
	leucine	leu	L
	lysine	lys	K
	méthionine	met	M
	phénylalanine	phe	F
	proline	pro	P
	sérine	ser	S
	thréonine	thr	T
	tryptophane	trp	W
	tyrosine	tyr	Y
	valine	val	V

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Formules des acides nucléiques

Formule générale	Nom	Présent dans
	Ribose	ARN
	Désoxy-ribose	ADN
	Thymine	ADN et ARNt
	Uracile	ARN
	Cytosine	ARN et ADN
	Guanine	ARN et ADN
	Adénine	ARN et ADN

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Définitions

ADN	acide désoxy-ribonucléique, molécule transportant l'information génétique. la réplication est la duplication de l'ADN et la transcription est la synthèse d'un brin d'ARN grâce au double brin d'ADN.
ADN dénaturé	ADN qui n'est plus sous forme double brin mais 2 brins séparés, il n'y a plus de liaisons hydrogènes entre les 2 brins.
Amorce	fragment d'ARN qui a pour seul but de founir une extrémité 3'oh à une polymérase lors de la réplication, ensuite elle se fait dégrader.
ARN	acide ribonucléique, molécule transportant l'information génétique. la réplication inverse est la synthèse d'ADN à partir de l'ARN, l'ARN réplicase permet de synthétiser de l'ARN avec comme matrice l'ARN et la traduction est la synthèse de protéines grâce à l'information génétique de l'ARN.
Excision épissage	maturation permettant d'éliminer les introns.
Exonucléasique	activité permettant d'enlever des nucléotides, dans le sens 3'->5' on parle d'activité correctrice ou encore proofreading.
Exons	partie codante d'un arnm eucaryotique.
Furanose	molécule dont le cycle est constitué de 5 atomes, exemple le fructose c₆h₁₂o₆ (voir pyrannose).
Histones	protéine autour de laquelle s'enroule l'ADN (175pb) qui permet de compacter l'ADN.
Introns	partie non codante d'un arnm eucaryotique.
Klenow	sous unité de l'ADN pol I des procaryotes : polymérase 5'->3' avec l'activité exonucléasique 3'->5'.
Nucléoside	molécule formée d'un sucre (ribose dans l'ARN, désoxy-ribose dans l'ADN) et d'une base (purique ou pyrimidique).
Nucléotide	nucléoside phosphorylé sur le c5' du sucre.
Okazaki	fragment d'ADN avec une extrémité 5' ARN (10 nucléotides) qui est formée pendant de la synthèse du brin tardif lors de la réplication.
Processivité	une enzyme processive est une enzyme qui est liée à l'ADN. moins une polymérase est processive plus elle aura tendance à se décrocher de l'ADN donc à synthétiser de petits fragments.
Proofreading	activité correctrice (donc 3'->5') d'une polymérase (toujours 5'->3').
Pyrannose	molécule dont le cycle est constitué de 6 atomes, exemple le glucose c₆h₁₂o₆ (voir furannose).
Réplication	duplication de l'ADN.
Splicing	action d'excision épissage.
TATA box	séquence d'ADN de 6 pb riche en a et en t (d'où son nom) reconnue par l'ARN polymérase ADN dépendante. cette boite est en position -10 par rapport au site d'initiation (+1).
Tautomére	se dit d'une substance chimique qui existe sous plusieurs formes en équilibre.
Tm	température de fusion : température à laquelle la moitié des brins sont dissociés.
Traduction	synthèse d'une protéine avec comme matrice de l'ARN.
Transcription	synthèse d'ARN avec comme matrice un brin d'ADN.